Другая работа художника - «Скалы на берегу моря»,- выполненная в окрестностях Алупки, тоже связана с пушкинской темой в живописи Магдесяна. Ее колорит и цветовая насыщенность при сравнении с первой картиной заметно приглушены. Значительно отличается и композиция работы. Серые глыбы скал замыкают полукружием небольшой залив, световые блики, упавшие на воду, высвечивают камни на дне.

К этому времени относится картина «Восход солнца на море» из собрания Государственного Русского музея. В темных коричневых тонах написана береговая полоса. Волны с белой кипенью пены набегают на песок. Недалеко от берега виден корабль. Вдали, в сиреневом мареве, белеет пятно паруса. Лимонно-желтое пламя восхода освещает воду. На свету вода кажется чуть фиолетовой с мягкими жемчужными оттенками, а в тени она темно-зеленая с синеватым отливом.

В апреле 1900 года Магдесян находился в Петербурге. Здесь его застала весть о кончине в Феодосии Айвазовского. Магдесян срочно выехал в Крым, чтобы отдать последний долг памяти художнику, приобщившему его к искусству и долгие годы оказывавшему ему помощь и поддержку. Вспоминая дни, проведенные с Айвазовским, Магдесян мысленно вернулся к словам мастера, обращенным к молодым художникам: «Между вами есть, вероятно, посвятившие себя пейзажной и морской живописи, на которых мои картины, быть может, произведут впечатление. Предостерегаю вас от увлечения и подражания этим картинам... Старайтесь быть реальными до последней степени, пока накопленный вами запас изучения и знания природы не даст вам права свободно переводить на полотно ваши личные художественные впечатления». Правда, заключенная в этих словах, имела непосредственное отношение к творческой судьбе самого Магдесяна.